Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPOP30536 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPOP30536 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPOP30536 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPOP30536 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPOP30536 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPOP30536 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms