Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERCC5P28715 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms