Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB4P28070 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms