Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3RAP26951 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3RAP26951 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms