Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NFKBIAP25963 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms