Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPREP23469 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPREP23469 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPREP23469 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPREP23469 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms