Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CD247P20963 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD247P20963 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD247P20963 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD247P20963 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD247P20963 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD247P20963 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD247P20963 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD247P20963 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD247P20963 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD247P20963 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD247P20963 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD247P20963 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD247P20963 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD247P20963 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms