Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD33P20138 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD33P20138 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD33P20138 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD33P20138 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD33P20138 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD33P20138 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD33P20138 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD33P20138 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CD33P20138 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD33P20138 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD33P20138 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD33P20138 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD33P20138 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD33P20138 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD33P20138 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD33P20138 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms