Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms