Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIG1P18858 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIG1P18858 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIG1P18858 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIG1P18858 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIG1P18858 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIG1P18858 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIG1P18858 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIG1P18858 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIG1P18858 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIG1P18858 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIG1P18858 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIG1P18858 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIG1P18858 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIG1P18858 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIG1P18858 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIG1P18858 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIG1P18858 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LIG1P18858 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIG1P18858 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIG1P18858 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIG1P18858 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIG1P18858 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIG1P18858 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIG1P18858 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIG1P18858 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms