Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATF3P18847 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF3P18847 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF3P18847 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF3P18847 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF3P18847 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF3P18847 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF3P18847 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF3P18847 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF3P18847 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF3P18847 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF3P18847 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF3P18847 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF3P18847 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF3P18847 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF3P18847 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF3P18847 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF3P18847 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF3P18847 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF3P18847 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF3P18847 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF3P18847 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF3P18847 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF3P18847 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF3P18847 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF3P18847 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF3P18847 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF3P18847 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF3P18847 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF3P18847 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF3P18847 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF3P18847 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF3P18847 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF3P18847 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF3P18847 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATF3P18847 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATF3P18847 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF3P18847 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF3P18847 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms