Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
CTPS1P17812 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms