Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN1P17600 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN1P17600 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN1P17600 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYN1P17600 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYN1P17600 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN1P17600 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYN1P17600 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN1P17600 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms