Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL3L1P16619 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms