Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms