Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2P10911 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2P10911 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2P10911 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2P10911 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2P10911 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2P10911 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2P10911 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2P10911 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2P10911 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2P10911 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2P10911 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2P10911 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2P10911 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2P10911 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2P10911 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2P10911 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2P10911 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2P10911 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2P10911 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2P10911 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2P10911 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2P10911 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCF2P10911 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCF2P10911 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCF2P10911 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCF2P10911 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms