Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGA3P0DJD8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms