Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC172P0C7W6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms