Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms