Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP3P08254 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP3P08254 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP3P08254 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP3P08254 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP3P08254 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP3P08254 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP3P08254 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms