Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG5P05408 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG5P05408 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG5P05408 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG5P05408 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCG5P05408 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCG5P05408 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCG5P05408 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCG5P05408 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCG5P05408 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCG5P05408 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCG5P05408 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCG5P05408 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCG5P05408 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCG5P05408 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCG5P05408 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCG5P05408 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms