Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms