Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSP01100 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSP01100 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSP01100 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSP01100 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSP01100 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSP01100 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSP01100 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSP01100 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSP01100 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSP01100 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSP01100 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSP01100 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSP01100 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSP01100 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSP01100 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSP01100 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSP01100 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSP01100 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSP01100 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSP01100 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOSP01100 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
FOSP01100 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOSP01100 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOSP01100 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSP01100 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSP01100 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSP01100 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSP01100 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSP01100 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms