Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD1O95696 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD1O95696 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD1O95696 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD1O95696 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD1O95696 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD1O95696 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD1O95696 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD1O95696 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD1O95696 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD1O95696 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD1O95696 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD1O95696 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD1O95696 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms