Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP19O94966 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP19O94966 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP19O94966 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP19O94966 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP19O94966 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP19O94966 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP19O94966 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP19O94966 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP19O94966 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP19O94966 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP19O94966 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP19O94966 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP19O94966 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP19O94966 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP19O94966 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP19O94966 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP19O94966 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP19O94966 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
USP19O94966 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP19O94966 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP19O94966 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms