Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEBLO76041 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEBLO76041 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEBLO76041 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEBLO76041 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEBLO76041 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEBLO76041 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEBLO76041 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEBLO76041 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEBLO76041 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEBLO76041 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEBLO76041 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEBLO76041 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEBLO76041 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms