Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPS6KA4O75676 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA4O75676 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms