Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TIPRLO75663 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIPRLO75663 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms