Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms