Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms