Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PDE6DO43924 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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