Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNAB3O43448 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms