Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC7A4O43246 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC7A4O43246 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms