Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSH5O43196 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSH5O43196 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSH5O43196 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSH5O43196 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSH5O43196 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSH5O43196 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSH5O43196 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSH5O43196 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSH5O43196 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSH5O43196 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSH5O43196 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSH5O43196 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSH5O43196 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSH5O43196 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSH5O43196 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSH5O43196 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSH5O43196 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSH5O43196 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSH5O43196 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSH5O43196 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSH5O43196 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSH5O43196 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSH5O43196 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MSH5O43196 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSH5O43196 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms