Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNM1O00562 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNM1O00562 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNM1O00562 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNM1O00562 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNM1O00562 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNM1O00562 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNM1O00562 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNM1O00562 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNM1O00562 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNM1O00562 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNM1O00562 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNM1O00562 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNM1O00562 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms