Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLRMTO00411 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms