Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUPT5HO00267 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SUPT5HO00267 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms