Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms