Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KNCNA6PVL3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms