Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144AA2RUR9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms