Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0U1RQS6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQS6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQS6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQS6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQS6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQS6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQS6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms