Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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