Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 LDHB-201ENST00000350669 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 TDRD12-201ENST00000421545 1317 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 KLRB1-201ENST00000229402 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 TRBV7-4-201ENST00000390369 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 TRBV7-7-201ENST00000390377 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC140479.1-201ENST00000440423 337 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 EFCAB2-207ENST00000447569 527 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AP003774.3-201ENST00000457725 985 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 PPIAP28-201ENST00000458378 485 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 RPL5P17-201ENST00000469685 877 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 RN7SL201P-201ENST00000482306 296 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC025465.1-201ENST00000503145 797 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC008629.3-201ENST00000505786 586 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 SCARNA20.3-201ENST00000516913 131 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 POLB-211ENST00000521492 786 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC090692.1-201ENST00000531569 541 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 LRP4-AS1-202ENST00000531719 731 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC078950.1-204ENST00000540635 523 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 LINC02455-201ENST00000541881 496 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC244131.1-201ENST00000542152 922 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC142086.3-201ENST00000563896 802 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC239803.3-201ENST00000614663 494 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC074029.3-201ENST00000618623 312 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 OR13D1-202ENST00000641530 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 TPD52-202ENST00000379097 2563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AP000705.2-201ENST00000433524 1386 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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SCN2BO60939 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AMZ2-210ENST00000580753 1339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC005840.3-201ENST00000541888 1803 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 TATDN2P1-201ENST00000443767 2331 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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SCN2BO60939 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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SCN2BO60939 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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SCN2BO60939 TRBV6-1-201ENST00000390353 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 RPL23AP7-201ENST00000391616 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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SCN2BO60939 AC093580.1-201ENST00000420549 671 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AL441992.1-201ENST00000443631 544 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC124861.1-201ENST00000457178 429 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 RN7SL505P-201ENST00000482644 293 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC108120.1-201ENST00000506543 991 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 ANAPC15-213ENST00000543050 807 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 CLEC4E-206ENST00000545274 730 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC073896.5-201ENST00000546464 542 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 THAP2-202ENST00000547843 672 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC026254.4-201ENST00000581118 454 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC005828.5-201ENST00000582741 355 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN2BO60939 AC093484.4-201ENST00000583934 461 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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