Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC099066.1-201ENST00000428148 534 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RPSAP53-201ENST00000433498 862 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR51R1P-201ENST00000435309 952 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL590094.1-203ENST00000435649 828 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC239859.3-201ENST00000456469 408 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RN7SL841P-201ENST00000470547 297 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GNGT2-205ENST00000511673 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC022441.1-201ENST00000512599 794 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RNA5SP159-201ENST00000517161 103 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RPL10P19-201ENST00000519013 301 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 IGKV3-34-201ENST00000521692 293 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ST3GAL4-219ENST00000534457 987 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 NTAN1P3-201ENST00000535885 715 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC034102.1-201ENST00000552016 604 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC122685.1-202ENST00000556750 555 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC061975.4-201ENST00000578466 776 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL021878.2-201ENST00000602718 399 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC137695.2-201ENST00000603123 754 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL121928.1-201ENST00000608017 521 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 FAM30B-201ENST00000611556 397 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GPC6-202ENST00000617456 792 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 FTH1-212ENST00000620041 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC024580.1-201ENST00000623020 674 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR7A2P-202ENST00000641312 1219 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MAPK10-343ENST00000641677 2546 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC01725-205ENST00000457273 1991 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC01260-201ENST00000415889 1416 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL008638.2-201ENST00000453934 2383 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 IL5RA-202ENST00000311981 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC108099.1-201ENST00000564402 3258 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MT-TS1-201ENST00000387416 69 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 APLF-202ENST00000394342 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MIR1269A-201ENST00000408636 105 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RN7SKP136-201ENST00000410927 300 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 NONOP2-201ENST00000414613 1231 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC023669.1-201ENST00000414915 524 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC104455.1-201ENST00000417340 736 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 KRT223P-201ENST00000422957 519 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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