Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A4Q9Y6R1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms