Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP3Q9Y6F1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms