Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms