Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms