Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUDCQ9Y266 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms