Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1024Q9UPX6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms